Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg3Q9CPX6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg3Q9CPX6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms