Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssxb1Q9CPU1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms