Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcl11bQ99PV8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11bQ99PV8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms