Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt23Q99PS0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt23Q99PS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms