Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim26Q99PN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms