Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms