Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc4Q99PH1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc4Q99PH1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms