Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims1Q99NE5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rims1Q99NE5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms