Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcgf6Q99NA9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcgf6Q99NA9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms