Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SrrtQ99MR6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrrtQ99MR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms