Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nus1Q99LJ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nus1Q99LJ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms