Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pagr1aQ99L02 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms