Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TriobpQ99KW3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TriobpQ99KW3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms