Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clint1Q99KN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clint1Q99KN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms