Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab28Q99KL7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab28Q99KL7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms