Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krcc1Q99JT5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krcc1Q99JT5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms