Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kdelr1Q99JH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdelr1Q99JH8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms