Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacsin3Q99JB8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms