Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec3Q99J72 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms