Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ctu1Q99J10 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ctu1Q99J10 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ctu1Q99J10 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ctu1Q99J10 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ctu1Q99J10 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctu1Q99J10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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