Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc8b1Q925Q3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc8b1Q925Q3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc8b1Q925Q3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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