Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn16Q925N4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn16Q925N4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn16Q925N4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn16Q925N4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cldn16Q925N4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn16Q925N4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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