Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gtpbp3Q923K4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gtpbp3Q923K4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Gtpbp3Q923K4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp3Q923K4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gtpbp3Q923K4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtpbp3Q923K4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms