Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf3b5Q923D4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf3b5Q923D4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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