Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms