Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spdl1Q923A2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spdl1Q923A2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms