Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Clip1Q922J3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clip1Q922J3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms