Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Afg3l1Q920A7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Afg3l1Q920A7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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