Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cts3Q91ZD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms