Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpm2Q91YD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm2Q91YD4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm2Q91YD4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms