Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdhac1Q91Y10 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdhac1Q91Y10 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms