Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec16bQ91XT4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms