Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Creb3l3Q91XE9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms