Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usb1Q91W78 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usb1Q91W78 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms