Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx9Q91VH2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx9Q91VH2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms