Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cabp4Q8VHC5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cabp4Q8VHC5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms