Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SelenomQ8VHC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SelenomQ8VHC3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms