Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc115Q8VE99 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc115Q8VE99 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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