Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol9aQ8VDU3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms