Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TgdsQ8VDR7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TgdsQ8VDR7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms