Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sft2d2Q8VD57 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms