Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BbxQ8VBW5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms