Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc58Q8R3Q6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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