Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Colec12Q8K4Q8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colec12Q8K4Q8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms