Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Defb12Q8K4N3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms