Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lin28aQ8K3Y3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin28aQ8K3Y3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms