Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssh3Q8K330 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssh3Q8K330 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms