Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsl1Q8K305 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms