Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccm2Q8K2Y9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms