Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms